El equipo anunció el despido de McCoy alrededor de una hora después de que los Chargers perdieron el domingo 37-27 ante los Chiefs de Kansas City.
McCoy había dicho en una conferencia de prensa posterior al partido que esperaba estar de vuelta el próximo año.
McCoy tiene marca de 27-37 en cuatro temporadas. Los Chargers pasaron a playoffs como comodín en su primera temporada, 2013, y vencieron a Cincinnati de visita para luego perder ante Denver en la ronda divisional.
Los Chargers llevaban foja de 8-4 al llegar a diciembre de 2014, pero luego perdieron tres de cuatro y quedaron fuera de la postemporada.
El año pasado concluyeron 4-12, y 5-11 esta campaña.
"El decepcionante desempeño de nuestro equipo no corresponde al potencial de esta escuadra y no ha cumplido con los elevados estándares que tratamos de imponer en nuestra organización", dijo John Spanos, presidente de operaciones deportivas de los Chargers, en un comunicado.